Bioimagexd. Perangkat lunak open source gratis untuk analisis dan visualisasi gambar biomedis multidimensi
Unduh sekarang

Bioimagexd. Peringkat & Ringkasan

Bioimagexd. Tag

menganalisa analisis Analyzer Menganalisis gambar biomedial memvisualisasikan gambar biomedis. analisis citra biomedis

Bioimagexd. Keterangan

Perangkat lunak open source gratis untuk analisis dan visualisasi gambar biomedis multidimensi BioIMAGEXD adalah perangkat lunak open source gratis yang akan membantu Anda menganalisis, memproses, dan membuat saluran multi dimensi, multi data, data gambar deret waktu dari mikroskop dan sumber lainnya. Berikut adalah beberapa fitur utama "BioimageXD": Penonton gambar: Buka data dalam format mikroskop umum (atau gambar atau tumpukan gambar, dan seri waktu), dan lihat gambar data dengan gambar. Format data yang didukung meliputi: · File Carl Zeiss .LSM · Olympusfv1000 .oif. · Leica Confocal Microscope file file SP2 .txt dan SP5 .LIF · Impor stack gambar bernomor · VTK XML Image Files · Penampilan gambar kira-kira sebanding dengan Carl Zeiss gratis dan pemirsa gambar produsen confocal lainnya, tetapi dengan rendering 3D yang lebih baik. Mode tampilan Avaialble adalah: irisan, bagian ortografis, proyeksi intensitas maksimum dan rendering 3D. Data seri waktu didukung. Pengolahan citra: · Sesuaikan warna / kecerahan / kontras / gamma, ubah warna atau palet dari dataset / saluran, filter kebisingan, benar untuk pemutihan fluoresensi dalam data deret waktu. · Segmentasi 3D dan objek Ananlysis. Render volume 3D: · Dataset 3D dapat secara interaktif volume yang diberikan, menggunakan · Perangkat lunak ray casting (lebih lambat tetapi tercantik. Acellerated dengan memiliki banyak prosesor) · Pemetaan tekstur kartu grafik OpenGL (lebih cepat tetapi resolusi lebih rendah - tergantung pada ukuran menor tekstur) · Terarecon Inc. VolumePro1000 Hardware Ray Casting Board (dukungan dalam pengembangan) · Fungsi transfer warna dan opacity didefinisikan sepenuhnya pengguna. Anda dapat memberikan volume dataset RGB multi-saluran yang digabungkan untuk melihat colokalisasi dalam 3D, atau membuat peta colokalisasi 3D. BioIMAGEXD menggunakan antarmuka VTK dengan OpenGL. Kami berencana untuk mengaktifkan tampilan stereo perangkat keras (halaman quad buffered flipping dan anaglyph biru merah, dan mode lainnya). Anda akan dapat mengeluarkan kacamata 3D dan benar-benar "melihat" data Anda! Ini adalah masa depan mikroskop 3D. Pembuatan film: · Gunakan modul Animator untuk mengatur jalur kamera di sekitar data 3D Anda, dan membuat film itu berputar dan terbang meskipun zooming cara apapun yang Anda suka. Data seri waktu didukung: "data 4D". · Analisis Kolokalisasi · Kami tahu semua ahli biologi sel Anda menggunakan mikroskop confocal selalu mencari kolokalisasi! Alat Kolokalisasi kami memungkinkan Anda untuk menganalisis colokalisasi intensitas sinyal dalam set data 3D multi-channel, menghindari masalah colokalisasi palsu yang terlihat dalam gambar proyeksi Z-Stack, dan melakukan beberapa analisis statistik yang memberi Anda angka-angka dan kualitas colokalisasi dalam data Anda. Menggunakan algoritma sama dengan yang di ImageJ, misalnya plugin WCIF untuk Automatic Colocalisation Ambang Batas, menggunakan metode Costes et al. · Manders koefisien dan analisis signifikansi statistik, dengan 2D histogram / sebar dan hasil statistik ekspor

Bioimagexd. Perangkat Lunak Terkait