Molekel. Aplikasi visualisasi molekul bebas dan terbuka untuk Mac Anda
Unduh sekarang

Molekel. Peringkat & Ringkasan

Molekel. Tag

membayangkan visualisator memvisualisasikan molekul molekul Molekul Visualizer visualisasi molekul

Molekel. Keterangan

Aplikasi visualisasi molekul sumber gratis dan terbuka untuk Mac Anda Molekel adalah sumber terbuka, mudah digunakan dan program visualisasi molekuler multi-platform gratis. Berikut adalah beberapa fitur utama "Molekel": · Baca data molekuler dari berbagai format file · Tampilan molekul dengan gaya yang berbeda: fokus, bola dan tongkat, bola dan kawat, tongkat, tulang punggung (residu), pita (residu), skematis (residu) · Ubah atom dan ukuran obligasi · Baca warna atom dari file · Menampilkan momen dipol (untuk format molekul yang berisi informasi ini) · Menghidupkan atom menggunakan lintasan dan informasi getaran yang tersedia dalam beberapa format file · Molekul Animate membaca dari file multi-bingkai PDB dan XYZ · Tampilkan panah untuk menunjukkan kecepatan dan arah gerak masing-masing atom animasi · Menghidupkan permukaan molekuler (saat mengekspor qimation) · Melakukan perhitungan sudut jarak dan (dihedral) · Gunakan probe planar untuk memvisualisasikan bidang skalar (mis. Potensi elektrostatik) dan menampilkan nilai bidang skalar pada titik tertentu dalam ruang 3D. · Memvisualisasikan permukaan ISO orbital molekuler secara opsional berkode warna dengan potensi elektrostatik. · Memvisualisasikan permukaan yang dihasilkan dari matriks densitas secara opsional berkode warna dengan potensi elektrostatik. · Memvisualisasikan permukaan dari data grid (dalam format Gaussian Cube atau baca dari file ADF Tape41) secara opsional berkode warna dengan potensi elektrostatik. · Permukaan halus yang dihasilkan dari data grid (Gaussian .Cube) dengan smoothing Laplacian · Gunakan data grid dibaca dari file .cube sebagai potensi elektrostatik molekuler untuk memetakan ke permukaan SAS dan SES · Menghitung permukaan yang dapat diakses pelarut karena permukaan ISO secara opsional berkode warna dengan potensi elektrostatik. · Menghitung dan menampilkan permukaan yang dikecualikan oleh pelarut, secara opsional menggunakan M.F. Program MSMS Sanner (sangat disarankan), dapatkan di sini · Molekul ekspor ke sejumlah format file molekuler · Ekspor ke POV (eksperimental, melalui openbabel) · Ekspor ke TIFF, PNG, PostScript dan PDF · Dukungan Shaders (GLSL) yang dapat diprogram · Visualisasi spektrum radiasi (infra-merah dan raman) · Rendering multi-pass berkualitas tinggi dengan rendering anti-aliasing dan benar dari permukaan transparan multi-layer berlapis · Memadukan mode getaran Apa yang baru dalam rilis ini: · Dukungan tambahan untuk mengupas kedalaman untuk rendering objek transparan yang benar; Membutuhkan kartu OpenGL 2.0 dan mungkin tidak berfungsi dengan baik pada beberapa sistem. Parameter peeling kedalaman yang mempengaruhi kecepatan rendering / kualitas objek transparan dapat diatur melalui dialog display-> view properti. · Menambahkan plot spektrum inframerah dan Raman dengan output PostScript dan PDF · Terintegrasi dengan VTK 5.1 (versi CVS karena belum ada rilis resmi) · Menambahkan dukungan untuk anti-aliasing, dinonaktifkan secara default; Dapat diaktifkan melalui dialog Display-> View Properties. · Sekarang dimungkinkan untuk mengubah transparansi dan warna permukaan orbital. · Menambahkan dukungan untuk pengaturan persisten dalam dialog Permukaan Densitas Elektron. · Menambahkan shader x-ray baru yang berfungsi dengan baik dengan VTK 5.1. Bug Tetap: · 392 - Tambahkan dukungan untuk input gamess multi-molekul · 401 - Tidak Dapat Menghapus Permukaan Connolly · 403 - Dukungan baris perintah · 404 - kesalahan membaca data orbital molekul · 405 - Transparansi Tidak konsisten untuk kedua warna orbital (tergantung pada kartu / driver tertentu) · 406 - animasi berjalan setelah menghapus molekul · 408 - Permintaan Fitur: Mulai indeks orbital dari nol · 420 - Pengaturan tidak disimpan saat menutup jendela · 421 - Permukaan dari data grid: waktu berlalu melaporkan salah · 422 - Tidak dapat menyimpan animasi dengan SES transparan

Molekel. Perangkat Lunak Terkait