jmodeltest. model filogenetik rata-rata
Unduh sekarang

jmodeltest. Peringkat & Ringkasan

jmodeltest. Tag

Systematics Phylogenetic. pengganti nukleotida. analisis filogenetik penganalisis filogenetik jejak filogenetik konteks filogenetik filogenetik Periksa probe filogenetik Pemeriksa Probe Phylogenetic Tes probe filogenetik menghitung jaringan filogenetik substitusi nukleotida Rata-rata model filogenetik Model filogenetik Simpan Jaringan Phylogenetic. Menganalisis data filogenetik Data filogenetik kekikiran tugas filogenetik Analisis filogenetik Bangun Supertrees Phylogenetic Buat Supertrees Phylogenetic Tes independensi filogenetik Analisis filogenetik tipikal hipotesis filogenetik Hubungan Filogenetik Rekonstruksi filogenetik topologi filogenetik Generator filogenetik Puncak rata-rata

jmodeltest. Keterangan

JModelTest adalah aplikasi ilmiah yang dapat melakukan pemilihan substitusi nukleotida, berguna dalam analisis DNA, dengan dukungan untuk paket data besar. Ini adalah proyek open-source, lintas platform yang menargetkan siswa, guru, serta peneliti di bidang DNA. Namun, sebagian besar analisis dilakukan secara otomatis, pengetahuan nukleotida canggih diharapkan dari pengguna, sebagian besar untuk interpretasi hasil. JModelTest bergantung pada lingkungan runtime Java untuk berjalan dengan sukses, tetapi itulah satu-satunya ketergantungan yang perlu Anda berikan. Itu muncul di dalam paket portabel, oleh karena itu instalasi tidak diperlukan. Antarmuka JModelTest cukup sederhana, tetapi fungsinya tertanam di dalamnya adalah sifat yang lebih kompleks. Sebagian besar GUI didedikasikan untuk analisis data dan laporan yang dihasilkan dari proses ini, yang, tergantung pada informasi yang terkandung di dalam file sumber, bisa cukup panjang. Ada lima strategi seleksi yang berbeda dan ini tertanam di dalam menu analisis, sebagai berikut: AIC (AKAINE Information Criterion), BIC (Bayesian Information Criterion), DT (Teori Keputusan), HLRT (Tes Rasio Kemungkinan Hirarkis) dan rata-rata filogenik. Semua ini dapat dikonfigurasi sebelum proses analisis aktual; Misalnya, Anda dapat menyesuaikan interval kepercayaan atau mengatur aplikasi untuk melakukan rata-rata model. Untuk melengkapi, Anda juga dapat menginstruksikan program untuk melakukan komputasi skor kemungkinan yang tergantung pada variasi tingkat yang dapat disesuaikan dan model pohon dasar yang dipilih sebelumnya. Kesimpulannya, Jmodeltest dapat menghemat waktu dan upaya para ilmuwan akan berinvestasi dalam melakukan operasi analisis DNA dengan cara tradisional. Namun, disarankan agar hasilnya diverifikasi secara menyeluruh, untuk berjaga-jaga. Diulas oleh Andreea Matei, terakhir Diperbarui pada 17 Agustus 2014

jmodeltest. Perangkat Lunak Terkait