Triplec.

Program untuk membangun pohon konsensus dari tiga kali lipat
Unduh sekarang

Triplec. Peringkat & Ringkasan

Iklan

  • Rating:
  • Nama Penerbit:
  • Arndt von Haeseler
  • Sistem operasi:
  • Windows All
  • Ukuran file:
  • 81 KB

Triplec. Tag


Triplec. Keterangan

Triplec dikembangkan untuk menjadi program untuk membangun pohon konsensus dari tiga kali lipat yang di-root. Penggunaan java -jar triplec.jar noreps infile.newick Di sini Noreps adalah jumlah rekonstruksi tiga kali lipat untuk digunakan untuk konsensus. Ini diperlukan karena rekonstruksi adalah algoritma acak. Untuk pohon-pohon kecil sekitar 20 taksa 1000 replikasi sudah cukup. Tetapi jumlah yang lebih besar harus digunakan untuk set data yang lebih besar. Infile.Newick adalah file teks dengan satu pohon baru per baris. Pohon-pohon dianggap di-root dan setiap pohon hanya mengandung label taksa dari pohon pertama. Itu adalah pohon setelah yang pertama tidak boleh mengandung taksa baru. Meskipun itu bukan kesalahan untuk memiliki pohon dengan taksa lebih sedikit daripada pohon pertama sebagai bagian dari konsensus, metode ini bukan metode super-pohon. Kinerja dalam kondisi ini belum diuji dan kami berharap akan berkinerja buruk.


Triplec. Perangkat Lunak Terkait

Sissi.

Simulasi evolusi urutan dengan interaksi khusus situs ...

203 104 KB

Unduh

Bazooka.

mendeteksi banyak spyware, adware, trojan, keylogger, foistware. ...

291 727 KB

Unduh