Spindel Workbench. Memperoleh metode untuk identifikasi spesies di semua domain kehidupan menggunakan analisis multipleks.
Unduh sekarang

Spindel Workbench. Peringkat & Ringkasan

Spindel Workbench. Tag

analisis urutan kinerja komputasi Efisiensi komputasi Platform Manajemen Platform Manajemen Internet Geometri komputasi komputasi Model komputasi Keuangan komputasi Komponen komputasi Biolog komputasi Astronomi Komputasi kimia komputasi urutan nukleotida. Masalah komputasi kekuatan komputasi neuroscience komputasi pendekatan komputasi menghasilkan karya seni komputasi Kecerdasan komputasi Manajemen Platform Azure. Manajemen proyek

Spindel Workbench. Keterangan

Spindel adalah pendekatan alternatif untuk identifikasi biologis berdasarkan panjang wilayah RNA (RRNA) ribosom. Secara umum, keberpihakan urutan gen rRNA primer dari spesies yang berbeda menunjukkan wilayah penggantian konservasi dan variasi nukleotida, baik dalam hal substitusi nukleotida (umumnya disebut peristiwa "SNP") dan insersi / penghapusan (Indel). Kehadiran indel menghasilkan urutan panjang yang berbeda dan memperkenalkan celah dalam penyelarasan, biasanya dilambangkan dengan tanda hubung "-". Konsep kami untuk identifikasi biologis menggunakan urutan gen RRNA sebagai berikut: Daerah konservatif digunakan untuk mendefinisikan segmen variabel ("wilayah hypervariable spindel") di mana kombinasi panjang urutan adalah karakteristik setiap spesies ("profil spindel"). Dengan demikian, setiap spesies dapat didefinisikan oleh profil numerik yang unik. Secara teori, survei hanya 6 daerah hipervariabel dengan 20 alel masing-masing (atau 11 daerah dengan 5 alel masing-masing) sudah cukup untuk mendiskriminasi semua spesies eukariotik di Bumi, yang diperkirakan antara 5 dan 15 juta jumlahnya. Dalam praktiknya, Spindel dapat mendiskriminasi 93,3% spesies eukariotik dengan variasi intraspesifik dan resolusi filogenetik yang tinggi.

Spindel Workbench. Perangkat Lunak Terkait