Silose Kelola model metabolisme Anda dengan bantuan alat ini
Unduh sekarang

Silose Peringkat & Ringkasan

Silose Tag

Plugin. penonton manipulator Plugin Cytoscape

Silose Keterangan

Sytoseed dibangun sebagai plugin cytoscape yang dapat membantu Anda melihat, memanipulasi, dan menganalisis model metabolisme yang dibuat menggunakan unggulan model. Plugin Cytose dirancang untuk memungkinkan pengguna unggulan model untuk membuat visualisasi informatif dari jaringan reaksi yang dihasilkan untuk organisme minat mereka. Pengguna dapat memuat model apa pun yang memiliki akses dalam benih model. Plugin Cytoseed mengunduh data model, reaksi, dan senyawa dari unggulan model, dan mengatur reaksi ke dalam jaringan berdasarkan peta jalur KEGG yang sesuai. Setelah beban awal (yang mungkin memakan waktu beberapa menit), data model disimpan di desktop pengguna dalam folder yang ditentukan untuk pemuatan cepat di sesi berikutnya. Fitur utama: mengunduh model dari benih model; Penciptaan sesi Cytoscape untuk memandang model; Menyimpan dan membuka kembali sesi Cytoscape Penciptaan dan Penghapusan Peta Jalan; Reaksi bergerak / menyalin antara peta jalur; Menyembunyikan / menampilkan node dalam Pathway Maps Visualisasi analisis variabilitas fluks menghasilkan beberapa media; Reaksi diwarnai berdasarkan kategori penting / aktif / tidak aktif / GAP diisi Kemampuan untuk membuka model untuk berbagai organisme dalam satu sesi Cytoscape, untuk memungkinkan analisis model komparatif Visualisasi hasil analisis saldo fluks

Silose Perangkat Lunak Terkait