Phylip. Paket program untuk menyimpulkan filogenies
Unduh sekarang

Phylip. Peringkat & Ringkasan

Phylip. Tag

pohon evolusioner kekikiran phylogeny.

Phylip. Keterangan

Paket Fylogeny Inferensi (Phylip) adalah paket program untuk menyimpulkan pohon evolusi (filogenisasi). Metode yang tersedia dalam paket termasuk parsimony, matriks jarak, dan metode kemungkinan, termasuk bootstrap dan pohon konsensus. Tipe data yang dapat ditangani termasuk urutan molekuler, frekuensi gen, situs pembatasan dan fragmen, matriks jarak, dan karakter diskrit. Program-program dikendalikan melalui menu, yang menanyakan kepada pengguna opsi yang ingin mereka atur, dan memungkinkan mereka untuk memulai perhitungan. Data dibaca ke dalam program dari file teks, yang dapat disiapkan oleh pengguna menggunakan prosesor kata atau editor teks (tetapi penting bahwa file teks ini tidak berada dalam format khusus dari pengolah kata itu - itu seharusnya masuk "Format" ASCII "atau" teks ""). Beberapa program analisis urutan seperti program penyelarasan clustalw dapat menulis file data dalam format Phylip. Sebagian besar program mencari data dalam file yang disebut "infile" - jika mereka tidak menemukan file ini mereka kemudian meminta pengguna untuk mengetikkan nama file file data. Output ditulis ke file khusus dengan nama-nama seperti "Outfile" dan "Outtree". Pohon yang ditulis ke "Outtree" berada dalam format baru, standar informal yang disepakati pada tahun 1986 oleh penulis sejumlah paket filogeni utama. Dapatkan Phylip dan cobalah untuk sepenuhnya menilai kemampuannya!

Phylip. Perangkat Lunak Terkait