Phire. mencari urutan genom bakteriophage untuk blok yang menampilkan urutan kesamaan.
Unduh sekarang

Phire. Peringkat & Ringkasan

Phire. Tag

pencari warna kesamaan kesamaan Variabel penting kesamaan. Browser Genome. Annotate Genome. Memvisualisasikan genom. Genom. Lihat kesamaan. display urutan gambar Seence Genome Sequence. genom sequence pencari Temukan urutan genom bakteriofag menganalisis genom analisis genom Lihat beberapa genom Cari Genome. Lihat urutan genom Genome Sequence Viewer. Tampilkan urutan genom Lihat Data Genome. menelusuri genom Lihat Genome. genom bahasa. algoritma kesamaan teks. genom prokariotik Analisis genom arabidopsis. pandangan Arabidopsis genom Analisis genom Arabidopsis. Analisis genom bakteri Visualisasi genom. Pemirsa genom Asosiasi Genom kesamaan semacam urutan Kesamaan Bandingkan urutan genom Urutan perbandingan genom urutan genom. Jalur browser genom UCSC Lihat File Genome. menampilkan data genom. Urutan genom bakteri Genome Explorer. genom mikroba ciri genom. Karakterisasi genom. Lihat genom bakteri kesamaan gambar persentase kesamaan kesamaan visual yang

Phire. Keterangan

Program Phire, program mandiri dalam Visual Basic, melakukan pencarian berbasis string algoritmik pada urutan genom bakteriofag, menemukan dan mengekstraksi blok menampilkan serangkaian urutan, sesuai dengan elemen peraturan yang dilestarikan yang terkandung dalam genom ini secara sistematis, tanpa eksperimental sebelumnya atau pengetahuan prediksi. Phire secara sistematis membandingkan semua substring DNA dengan panjang yang ditentukan (L) satu sama lain, memungkinkan sejumlah ketidakcocokan (degeneracy d) untuk memilah dan mengekstrak set terbesar (dominan) substring yang mewakili konsensus unik. Dengan cara ini, seluruh genom akan dianalisis pada Watson dan Crick DNA Strand juga. Untuk memvisualisasikan urutan di sekitar urutan konsensus, ukuran jendela (W) dapat diadaptasi untuk memasukkan urutan kiri dan kanan setiap string individu DNA yang dipilih.

Phire. Perangkat Lunak Terkait