Penyelarasan statistik yang cepat untuk Linux FSA adalah algoritma penyelarasan urutan multiple probabilistik.
Unduh sekarang

Penyelarasan statistik yang cepat untuk Linux Peringkat & Ringkasan

Penyelarasan statistik yang cepat untuk Linux Tag

Penyelarasan statistik yang cepat untuk Linux Keterangan

Iklan Penyelarasan statistik cepat untuk Linux adalah perangkat lunak rumah dan pendidikan yang dikembangkan oleh Robert Bradley. Setelah uji coba dan tes kami, perangkat lunak terbukti resmi, aman dan gratis. Berikut adalah deskripsi resmi untuk penyelarasan statistik yang cepat untuk Linux: FSA adalah algoritma penyelarasan urutan multiple probabilistik yang menggunakan pendekatan "berbasis jarak" untuk menyelaraskan protein homolog, RNA atau urutan DNA. Berbagai macam metode rekonstruksi filogenetik berbasis jarak seperti tetangga-bergabung membangun filogeni hanya menggunakan estimasi divergensi berpasangan, FSA membangun keselarasan berganda hanya menggunakan estimasi homologi berpasangan. Ini dimungkinkan oleh teknik anil urutan untuk membangun beberapa penyelarasan dari perbandingan berpasangan. FSA membawa akurasi tinggi yang sebelumnya hanya tersedia untuk analisis protein atau RNA skala kecil hingga masalah skala besar seperti menyelaraskan ribuan sekuens atau urutan panjang megabase. FSA memperkenalkan beberapa metode baru untuk membangun keberpihakan yang lebih baik: FSA menggunakan teknik pembelajaran mesin untuk memperkirakan parameter GAP dan substitusi dengan cepat untuk setiap set urutan input. Metode penyelarasan "pembelajaran khusus" ini membuat FSA sangat kuat: dapat menghasilkan keberpihakan unggul dari set urutan homolog yang tunduk pada kendala evolusi yang sangat berbeda. FSA mampu menyelaraskan ratusan atau bahkan ribuan urutan menggunakan algoritma inferensi acak untuk mengurangi biaya komputasi dari keselarasan ganda. Inferensi acak ini dapat lebih dari sepuluh kali lebih cepat daripada pendekatan langsung dengan sedikit kehilangan akurasi. FSA dapat dengan cepat menyelaraskan urutan yang sangat lama menggunakan teknik "Anchor Annealing" untuk menyelesaikan jangkar dan memproyeksikannya dengan penahan transitif. Kemudian menjahit keselarasan antara jangkar menggunakan metode yang dijelaskan di atas. Termasuk GUI, MAD (Tampilan Penjajaran Berganda), dapat menampilkan keberpihakan menengah yang dihasilkan oleh FSA, di mana setiap karakter diwarnai sesuai dengan probabilitas yang diselaraskan dengan benar

Penyelarasan statistik yang cepat untuk Linux Perangkat Lunak Terkait