Makrata.

Hitung tingkat evolusi relatif dengan bantuan alat ini.
Unduh sekarang

Makrata. Peringkat & Ringkasan

Iklan

  • Rating:
  • Lisensi:
  • Freeware
  • Nama Penerbit:
  • Itay Mayrose
  • Sistem operasi:
  • Windows All
  • Ukuran file:
  • 411 KB

Makrata. Tag


Makrata. Keterangan

Sejauh mana situs asam amino bebas untuk bervariasi sangat tergantung pada kepentingan struktural dan fungsionalnya. Asam amino yang memainkan peran penting, seperti yang ada di dalam lokasi aktif protein, tidak mungkin berubah dari waktu evolusi. Oleh karena itu, tingkat evolusi di lokasi asam amino adalah indikasi seberapa konservasi situs ini, dan pada gilirannya, memungkinkan mengevaluasi pentingnya situs ini dalam menjaga struktur atau fungsi protein. MCRATE adalah alat yang berguna, mudah digunakan yang dirancang khusus untuk menghitung tingkat evolusi relatif di setiap situs menggunakan model evolusi berbasis probabilistik. Ini memungkinkan memperhitungkan proses stokastik evolusi urutan yang mendasarinya dalam keluarga protein. Yang paling penting, markrat menggunakan metodologi Markov Chain Monte Carlo (MCMC) untuk mengintegrasikan ruang semua pohon yang mungkin. Oleh karena itu, mcrate tidak menganggap pohon filogenetik yang sudah ada sebelumnya di mana urutannya berhubungan. Mcrate ditemukan lebih unggul atas metode Na? Ve yang hanya mengandalkan pohon tunggal.


Makrata. Perangkat Lunak Terkait