Iqpnni.

Pengoperasian Kuartet Penting dan Operasi NNI
Unduh sekarang

Iqpnni. Peringkat & Ringkasan

Iklan

  • Rating:
  • Lisensi:
  • Freeware
  • Nama Penerbit:
  • Arndt von Haeseler
  • Sistem operasi:
  • Windows All
  • Ukuran file:
  • 1.6 MB

Iqpnni. Tag


Iqpnni. Keterangan

Nama IQPNI adalah singkatan dari pengoperasian kuartet dan NNI yang penting. Metode rekonstruksi pohon yang efisien (IQPNNI) diperkenalkan untuk merekonstruksi pohon filogenetik berdasarkan data urutan asam DNA atau amino. Pendekatan kami menggabungkan berbagai algoritma cepat untuk menghasilkan daftar pohon kandidat potensial. Bahan utama adalah definisi dari apa yang disebut kuartet penting (IQ), yang memungkinkan perhitungan pohon perantara di O (n ^ 2) waktu untuk urutan n. Pohon yang dihasilkan kemudian dioptimalkan lebih lanjut dengan menerapkan operasi tetangga Interchange (NNI) terdekat. Selanjutnya fraksi acak dari urutan dihapus dari pohon terbaik yang ditemukan sejauh ini. Urutan yang dihapus kemudian dimasukkan kembali di pohon kecil menggunakan algoritma kuartet puzzling (IQP) yang penting. Langkah-langkah ini diulang beberapa kali dan pohon terbaik, sehubungan dengan kriteria kemungkinan, dianggap sebagai pohon filogenetik yang disimpulkan. Selain itu, kami menyarankan aturan, yang menunjukkan kapan harus menghentikan pencarian. Fitur utama: Estimasi parameter model gagal dalam kasus langka untuk model kaya parameter Invar + gamma Heterogeneity Masalah Kompatibilitas dengan GCC 4.3.2 Pohon Bionj sekarang direkonstruksi dua kali dari jarak awal dan jarak maksimum-kemungkinan yang dikoreksi


Iqpnni. Perangkat Lunak Terkait

Bazooka.

mendeteksi banyak spyware, adware, trojan, keylogger, foistware. ...

291 727 KB

Unduh

Tentang kami