Gnlab Pipa Komputasi untuk Analisis Jaringan Gen Skala Besar
Unduh sekarang

Gnlab Peringkat & Ringkasan

Gnlab Tag

analisis SSIS Pipeline. struktur kinerja komputasi Efisiensi komputasi pipa Geometri komputasi komputasi Pipa Kustom Model komputasi jaringan besar Pipa otomatis penyebaran skala besar Keuangan komputasi Komponen komputasi Biolog komputasi Astronomi Komputasi pipa daisy Penelope Cruz wallpaper kimia komputasi Analisis Gene. menghasilkan awan skala besar Analisis Gen Microarray. Analisis Ekspresi Gene. Masalah komputasi kekuatan komputasi Pipeline Component Tester. Uji komponen pipa pipa decode neuroscience komputasi Pipeline Fashion. jaringan gen-reaksi-protein pendekatan komputasi Buat Jaringan Gene. generator jaringan gen. analisis gen coding protein Analisis Pipeline. Analisis Data Gene. menghasilkan karya seni komputasi mensimulasikan jaringan gen yang tumbuh Hasilkan Gene Network. Analisis Data Frekuensi Gen Analisis Filogalan Besar Pipa komputasi Analisis skala besar Struktur Statis Kecerdasan komputasi pipa segmentasi. Analisis Gene Modifier Analisis Data Ekspresi Gen memproses pipa besar-besaran AVG Freewall gratis Avipreview Ares. .snd untuk mengirim pesan teks fruity loop dj Blaze HDTV Driver. perangkat lunak suku cadang mobil Unduh Video Mixer. Alif Baa Quran. Sentuh Keyboard V1.0. iball pen drive. File Explorer 2690. ssh server angin

Gnlab Keterangan

Nama Gnlab adalah singkatan dari Gene Network Virtual Laboratory. Gnlab dikembangkan menjadi alat bioinformatika baru untuk analisis skala besar dari Jaringan Pengaturan Gen (GRNS). Alat baris perintah C ++ ini mendukung analisis struktur statis dan perilaku dinamis GRN. GNLAB dikembangkan untuk mendukung desain dan implementasi eksperimen komputasi berulang skala besar pada GRNS. Gnlab terdiri dari komponen yang dapat dipisahkan untuk pembuatan jaringan, simulasi, analisis, visualisasi, perbandingan dan inferensi. Melalui penggunaan skrip yang ditentukan pengguna, komponen-komponen ini dapat disatukan untuk membangun pipa analisis GRN. Setiap komponen dapat dipanggil oleh opsi baris perintah. Fitur utama: Generasi Jaringan: Tiga model pertumbuhan jaringan tersedia di Gnlab. Jaringan acak dapat dihasilkan oleh ERDOS-RENYI model (-R), model bebas skala (-F), atau model Charleston-Ho (-g). Model Charleston-Ho adalah model pertumbuhan jaringan yang baru diusulkan yang didasarkan pada proses yang terkenal dalam evolusi genom. Model ini terbukti menangkap struktur topologi terperinci dari GRN nyata (HO dan Charleston, dalam persiapan). Visualisasi jaringan: GNLAB dapat menghasilkan file input untuk GraphViz, Geomi dan Cytoscape. Fungsi ini dapat dipanggil oleh opsi baris perintah -v. simulasi jaringan: menggunakan kinetika bukit, pola ekspresi gen GRN dapat disimulasikan baik secara deterministik atau stokastik. Data untuk profil ekspresi gen time-series dapat dihasilkan dengan memohon opsi baris perintah -t. Data simulasi disimpan dalam file teks dengan ekstensi ".data". Tiga jenis dataset microarray dapat disimulasikan oleh GNLAB: seri waktu, gangguan gen, dan dataset khusus kondisi. Opsi baris perintah digunakan untuk memanggil simulasi data microarray. Analisis Jaringan : Struktur statis dari GRN dapat diukur dengan koleksi fitur jaringan topologi. Satu set 11 fitur topologi dihitung dalam gnlab. Perbandingan Jaringan: The topologi kesamaan antara dua jaringan dengan jumlah yang sama node dapat dihitung di GNLab. Perbandingan jaringan dipanggil melalui baris perintah option -c. Ringkasan satu baris dari perbedaan topologi antara dua jaringan yang dicetak, ke konsol. Jaringan Inferensi: GNLab tidak melakukan inferensi jaringan secara langsung. Namun, hal itu memungkinkan microarray dataset yang dihasilkannya untuk dikonversi menjadi format input ARACNe dan Banjo. Proses ini dipanggil oleh -d opsi baris perintah.

Gnlab Perangkat Lunak Terkait