Dnadistree.

Perangkat lunak untuk inferensi filogeny berbasis jarak dari urutan DNA.
Unduh sekarang

Dnadistree. Peringkat & Ringkasan

Iklan

  • Rating:
  • Lisensi:
  • Freeware
  • Nama Penerbit:
  • Christian Michel
  • Sistem operasi:
  • Windows All
  • Ukuran file:
  • 393 KB

Dnadistree. Tag


Dnadistree. Keterangan

DNAdistree dirancang untuk menyimpulkan pohon filogenetik berbasis jarak yang menampilkan hubungan topologi yang akurat di antara spesies. Lebih tepatnya, Dnadistree melakukan beberapa langkah berturut-turut: 1. Membaca penyelarasan urutan DNA (nukleotida atau kodon); 2. Ini memperkirakan jarak berpasangan yang tidak bias antara setiap pasangan sekuens. Untuk tujuan itu, DNAdistree menggunakan banyak formula yang sering didasarkan pada model evolusi dari model DNA atau kodon (lihat di sini untuk lebih jelasnya); 3. Ini membangun pohon filogenetik berkat empat algoritma aglomeratif; 4. Ini menghitung langkah-langkah statistik terkait dengan matriks jarak dan / atau pohon berbasis jarak. Namun demikian, Dnadistree tidak dirancang untuk memperkirakan panjang cabang yang kuat; Disarankan untuk menggunakan Fitch (dalam paket Phylip), fastme, phyml atau paml dengan pohon-pohon yang disimpulkan oleh DnadeDistree sebagai pohon pengguna untuk perkiraan panjang cabang berbasis jarak yang lebih tepat atau. Berikan dnadeDistree a coba lihat apa yang benar-benar mampu!


Dnadistree. Perangkat Lunak Terkait