Cvit. Lihat kromosom dengan bantuan alat ini
Unduh sekarang

Cvit. Peringkat & Ringkasan

Cvit. Tag

penonton melihat kromosom urutan genom.

Cvit. Keterangan

CVIT, Short for Chromosome Viewing Tool dirancang sebagai aplikasi Perl yang dapat digunakan untuk dengan cepat menghasilkan gambar PNG yang menunjukkan fitur pada berbagai peta atau pada urutan genom. Ini sengaja sederhana dan non-interaktif, meskipun mungkin untuk membungkus CVIT di dalam, misalnya, halaman web interaktif. Input terdiri dari satu atau lebih file data dalam format GFF3. Data harus berisi catatan yang menggambarkan satu atau lebih "kromosom" (yang dapat mewakili grup tautan, psuedomolecule, bac, contig, segala jenis bentangan dna yang berdekatan, atau bahkan struktur protein). "Kromosom" ini adalah tulang punggung yang ditempatkan fitur. CVIT akan menampilkan sistem koordinat yang bersebelahan, termasuk pasangan dasar, sentimorgans (peta genetik) dan centimclintoks (peta sitogenetik). Koordinat dapat berjalan maju (terkecil hingga terbesar) atau mundur (terbesar ke kecil). Output terdiri dari gambar PNG dari kromosom dan fitur, gambar legenda, dan daftar koordinat fitur.

Cvit. Perangkat Lunak Terkait