Clustal x.

Aplikasi ini menampilkan program penyelarasan urutan berganda secara umum untuk DNA atau protein.
Unduh sekarang

Clustal x. Peringkat & Ringkasan

Iklan

  • Rating:
  • Lisensi:
  • Freeware
  • Nama Penerbit:
  • The European Bioinformatics Institute
  • Sistem operasi:
  • Windows All
  • Ukuran file:
  • 4.7 MB

Clustal x. Tag


Clustal x. Keterangan

CLUSTAL X adalah program lanjutan yang berurusan dengan ganda urutan untuk protein dan DNA. Dirancang sebagai GUI untuk CLUSTALW, program ini melakukan analisis urutan mendalam, sementara juga menawarkan banyak utilitas untuk melakukan perbandingan yang tepat. Muat beberapa format khusus. Program dapat bekerja dengan urutan siap, impor dari file format berikut: EMBL / Swissprot, NBRF / PIR, Pearson (FACKA), GCG / MSF (PileUp), Clustal (* .aln), GCG9 / RSF dan GDE. Selama proses impor, clustal x mencoba untuk mendeteksi apakah urutannya nukleotida atau asam amino, tetapi tidak ada jaminan aktual bahwa pilihan akan benar. Secara cerdik menyoroti elemen-elemen penting. File sumber telah dimuat, penyelarasan urutan akan ditampilkan di jendela utama program. Skema pewarnaan internal berfungsi untuk menyoroti fitur-fitur yang dilestarikan, membuatnya muncul melalui warna-warna cerah. Untuk membedakan isi urutan, disarankan agar Anda menggunakan font yang lebih besar; Ini akan menghasilkan tampilan urutan yang diperbesar, membuatnya lebih mudah untuk menemukan komposisinya. Proses keselarasan yang mudah, operasi yang diizinkan oleh program membuat daftar cukup; Anda dapat menambahkan urutan ke penyelarasan yang ada, memotong atau menempelkan fragmen, serta untuk mencari string atau untuk menghilangkan celah yang ada. Juga, Anda dapat melakukan penyelarasan melalui salah satu metode berikut: Lengkap (urutan akan menjalani analisis penuh), Pandu Pohon hanya atau penataan ulang urutan yang dipilih dan / atau rentang residu. Disarankan bahwa sebelum memulai proses penyelarasan, Anda mengatur ulang semua parameter (celah baru, celah protein) agar hasilnya konklusif. Menganalisis data dan mendapatkan skor kualitas penyelarasan indikasi paling penting dari analisis akan menjadi skor kualitas penyelarasan, yang diplot untuk setiap kolom secara individual. Skor tinggi menunjuk kolom yang dilindungi dengan baik, sementara tingkat konservasi rendah ditunjukkan oleh skor yang lebih rendah. Kesimpulannya, analisis tergantung pada berbagai parameter, yang harus ditetapkan sesuai dengan tujuan ilmiah yang perlu dilakukan. Paling pasti, program ini membuat pilihan yang bagus untuk para ilmuwan, serta siswa yang ingin membuat operator dari sekuensing DNA. Diulas oleh Andreea Matei, Baru Diperbarui pada 21 Juli 2014


Clustal x. Perangkat Lunak Terkait

HP11-W.

Program emulator Windows yang nyaman untuk HP11C ...

251 728 KB

Unduh