 | pknotssrg.Pencocokan Lipat RNA dan Termodinamika |
| Unduh sekarang | |
pknotssrg. Peringkat & Ringkasan
Iklan
- Lisensi:
- Freeware
- Harga:
- FREE
- Nama Penerbit:
- pknotsRG Team
- Situs web penerbit:
- http://bibiserv.techfak.uni-bielefeld.de/pknotsrg/
- Sistem operasi:
- Mac OS X
- Ukuran file:
- 359 KB
pknotssrg. Tag
pknotssrg. Keterangan
Pencocokan Lipat RNA dan Termodinamika PKNOTSSTRG adalah alat berbasis baris perintah gratis dan mudah digunakan untuk lipat struktur sekunder RNA, termasuk kelas pseudoknot rekursif sederhana. Parameter energi untuk struktur yang mengandung tidak ada pseudoknots sama dengan pada Metfeth 3.1 yang sebenarnya. Energi untuk pseudoknot dihitung dengan model yang mirip dengan yang digunakan oleh Rivaseddy pada pnots. Suhu lipat diperbaiki hingga 37c. Saat ini, ada tiga mode berbeda yang tersedia: · PknotsSTRG-MFE: menghitung struktur S (diikat atau tidak) energi bebas minimal. · PknotsSTRG-ENF: Menegakkan pseudoknot: Ini memberikan yang energik Struktur Lengkap Terbaik yang mencakup setidaknya satu pseudoknot di suatu tempat. · PknotsSTRG-LOC: Memberikan pseudoknot lokal terbaik yang dapat menjadi elemen dari struktur S, di mana "Best" didefinisikan oleh energi bebas per nukleotida. Sisanya tetap berlangsung. Apa yang baru dalam rilis ini: · Tidak perlu perpustakaan kolektor sampah lagi · Mode interaktif · Dukungan untuk input file FASTA · Opsi baru -W: jendela geser · Opsi baru -S: Lebar output untuk struktur
pknotssrg. Perangkat Lunak Terkait
