Pipa Penanda Intron Desain primer inton mengapit menggunakan EST sebagai templat dalam spesies dengan tidak terbatas pada urutan genom
Unduh sekarang

Pipa Penanda Intron Peringkat & Ringkasan

Pipa Penanda Intron Tag

urutan Pipa Penanda Intron Mengungkapkan urutan tag EST urut Est Intron.

Pipa Penanda Intron Keterangan

Desain primer intron mengapit menggunakan EST sebagai templat dalam spesies dengan terbatas pada tidak ada urutan genom Pipa Pipeline Marker Intron (IMP) telah dikembangkan sebagai alat otomatis untuk desain primer yang mengapit lokasi intron dalam tag urutan yang diungkapkan (EST). Intron Marker Pipeline (IMP) bertujuan untuk menggambarkan spesies dengan tidak ada data urutan genom yang tersedia. Semua yang diperlukan untuk input adalah file fasta yang berisi urutan EST dan file FASPA lain yang berisi urutan genom yang akan digunakan untuk prediksi intron. Ini memungkinkan fleksibilitas optimal bagi pengguna, memungkinkan mereka untuk mengontrol urutan yang tepat yang digunakan. Instruksi instalasi: · Unduh distribusi saat ini · Buka kemasan (akan membuat sendiri memuat folder) menggunakan nama file tar -zxvf di terminal · Instal reapeatmasker, blat, geneseqer dan utilitas baris perintah primer3 dan mencatat di executable untuk dan termasuk One (ex: / usr / local / share / aplikasi primer3 / src / primer_core) · Jalankan perl install.pl di direktori basis IMP · Masukkan jalur sudah dicatat ketika diminta persyaratan: · Ulangi MASKUKER · BLAT. · Geneseqer. · Utilitas baris perintah primer3

Pipa Penanda Intron Perangkat Lunak Terkait