Palma MRNA ke Alignment Genome Menggunakan Algoritma Margin Besar
Unduh sekarang

Palma Peringkat & Ringkasan

Palma Tag

genom. meluruskan pelurus sequence aligner. Align Genome. penyelaras genom

Palma Keterangan

MRNA untuk keberpihakan genom menggunakan algoritma margin besar Palma menyelaraskan dua urutan genom dengan cara yang optimal sesuai dengan algoritma yang mendasarinya dan parameter terlatih. Script Python utama membutuhkan dua file fasta yang berisi target (mis. Urutan DNA, bagian dari genom) dan urutan permintaan (mis. Urutan CDNA atau EST). Palma menciptakan penyelarasan menggunakan pemrograman dinamis (ditulis dalam C ++), dan mengembalikan penyelarasan dalam format seperti PSL. Algoritma akan menjadi yang akan menghitung keberpihakan lokal yang optimal, jadi jika tidak ada penyelarasan yang ditemukan itu karena tidak ada penyelarasan yang mendapat skor penyelarasan yang cukup tinggi. Persyaratan: · Shogun. · Python.

Palma Perangkat Lunak Terkait