Midas. Peringkat & Ringkasan
- Nama Penerbit:
- Dana Farber Cancer Institute
- Situs web penerbit:
- http://www.dfci.harvard.edu/
Midas. Tag
Midas. Keterangan
Sistem analisis data microarray gratis Sistem Analisis Data Microarray adalah aplikasi Java gratis yang menyediakan antarmuka intuitif kepada pengguna untuk merancang protokol analisis yang menggabungkan satu atau lebih normalisasi dan langkah-langkah penyaringan. Dengan cara ini, data dari banyak hibridisasi individu dapat diobati dengan cara yang seragam dan dapat direproduksi. Midas membaca file ".tav" yang dihasilkan oleh Tigram Spotfinder atau diambil dari database melalui Madam. Modul normalisasi termasuk regresi linier tertimbang lokal (rendah; (Cleveland dan Devlin, 1988; Yang et al., 2002)) dan normalisasi intensitas total. Ini dapat dihubungkan dengan filter, termasuk cutoff intensitas rendah, pemotongan skor Z-dependen intensitas, dan mereplikasi pemangkasan konsistensi, menciptakan metode yang sangat dapat disesuaikan untuk menyiapkan data ekspresi untuk perbandingan dan analisis selanjutnya. Metode analisis data dibangun menggunakan bahasa skrip grafis yang intuitif dan dapat disimpan untuk aplikasi ke dataset lain. Midas menyediakan scatterplots yang menggambarkan efek dari setiap algoritma pada data. Ketika langkah normalisasi dan penyaringan selesai, midas menampilkan data dalam format TAV. Persyaratan: · Java 1.4.1 atau lebih baru
Midas. Perangkat Lunak Terkait