KoriBlast. menyediakan beberapa antarmuka pengguna grafis dan alat analisis untuk melihat dengan mudah dan untuk mengeksplorasi hasil ledakan.
Unduh sekarang

KoriBlast. Peringkat & Ringkasan

KoriBlast. Tag

LEDAKAN pertanyaan hasil menganalisis data mesin BLAST Hasil kueri

KoriBlast. Keterangan

Menyediakan beberapa antarmuka pengguna grafis dan alat analisis untuk dilihat dengan mudah dan untuk menjelajahi hasil ledakan. Koriblast adalah lingkungan grafis yang andal yang didedikasikan untuk penambangan data urutan. Koriblast menggabungkan pencarian ledakan dengan kemampuan manajemen data canggih dan antarmuka pengguna grafis canggih. KoriBlast mengusulkan penjadwal ledakan grafis yang mampu dibandingkan pada saat yang sama beberapa urutan kueri terhadap beberapa basis data urutan menggunakan jaringan atau mesin ledakan lokal. Koriblast menyediakan beberapa antarmuka pengguna grafis dan alat analisis untuk melihat dengan mudah dan untuk mengeksplorasi hasil ledakan dengan cara yang bermakna, memfasilitasi interpretasi data. Selain itu, KoriBlast mampu mengambil data secara otomatis dari database NCBI Entrez, mengintegrasikan informasi berharga langsung ke dalam laporan ledakan grafis. Akhirnya, semua informasi yang tersedia dari KoriBlast dapat ditanyakan memungkinkan Anda untuk dengan cepat menemukan informasi yang relevan sambil mengurangi jumlah data ke analse.note: Untuk mengunduh dan menerima kunci lisensi yang akan memungkinkan Anda mendaftar. Berikut adalah beberapa fitur utama "KoriBlast": · Perangkat lunak grafis yang ramah dan mudah dipelajari. · Penjadwal ledakan untuk melakukan pencarian dengan beberapa urutan kueri terhadap beberapa database secara bersamaan. · Kueri ledakan dijalankan menggunakan server NCBI Blast atau instalasi ledakan lokal. · Alat analisis grafis terintegrasi dengan cerdik memberikan sistem penambangan ledakan yang sangat efisien. · Impor data tambahan (fitur hit yang diketahui) dengan akses langsung dan transparan ke sumber data biologis. · Data yang diimpor adalah: terintegrasi dalam hasil ledakan, ditampilkan dalam laporan grafis, tersedia untuk menyaring hasil ledakan. · Temukan informasi yang relevan menggunakan filter. · Kurangi jumlah data untuk dianalisis menggunakan filter. · Data yang disimpan pada drive disk pengguna tetap tersedia dari waktu ke waktu. · Data ekspor ke aplikasi spreadsheet. · Ambil urutan hit penuh dari database urutan jarak jauh. · Ekspor urutan tekan penuh ke file fasta. · BLAST kembali permintaan ledakan sebelumnya dengan satu klik mouse. · RE-BLAST urutan hit penuh dengan satu klik mouse. · Tampilkan entri hit penuh menggunakan browser web favorit Anda. Persyaratan: · PowerPC (G3 atau lebih baru) atau prosesor Intel Pentium. · Mesin virtual Java (JVM) 1.5.0 atau lebih tinggi. · Setidaknya 128 bulan RAM (direkomendasikan 256 mo). · Resolusi layar 1024 oleh 728 piksel. Keterbatasan: · Periode percobaan 14 hari. Apa yang baru dalam rilis ini: · Pencarian psi-ledakan tersedia dari modul pencarian dan modul analisis telah diadaptasi untuk memungkinkan analisis yang diperpanjang dari hasil (lihat gambar di bawah ini, dan melihat video ini). · Persiapkan file blast pribadi dari genbank asli, genpept, embl, swissprot dan file uniprot, menggunakan file polos atau file terkompresi gzip (lihat video ini). · Instal PRA-formatted NCBI Blast Bankss langsung dari file 'tar.gz' asli (lihat video ini). · Desain filter pencarian yang memungkinkan pola pencocokan pada urutan hit. · Bandingkan hasil pencarian untuk menemukan hit baru, umum atau dihapus. · Ekspor file dan filter data Koriblast untuk dibagikan dengan kolega yang memiliki KoriBlast atau Blastviewer. · Penampil urutan baru untuk menampilkan dan memanipulasi urutan (ekstrak, menerjemahkan, mendapatkan komposisi) yang diunduh dari repositori publik (lihat gambar di bawah). · Penanganan proyek besar yang lebih baik yang melibatkan ribuan urutan.

KoriBlast. Perangkat Lunak Terkait