Greylag perangkat lunak untuk identifikasi peptida spektrum massa tandem
Unduh sekarang

Greylag Peringkat & Ringkasan

Greylag Tag

mengenali mengesahkan validasi peptida spektral Identifikasi spektral peptida peptida spektral

Greylag Keterangan

Perangkat lunak untuk identifikasi peptida spektrum massa tandem Perangkat lunak identifikasi dan validasi peptida spektral massal tandem, mirip dengan X! Tandem, Omssa, MyRimatch. Greylag cocok untuk host tunggal melalui cluster besar. GREYLAG ditulis dalam Python untuk kesederhanaan, dengan bagian kinerja-kritis di C ++. Persyaratan: · Python. Apa yang baru dalam rilis ini: · Program baru `` greylag-reannotate`` mengambil satu set file SQT dan fasta · Basis data dan membatalkan peptida yang ditemukan seolah-olah pencarian telah dilakukan · Melawan basis data yang ditentukan. (Ini biasanya jauh lebih cepat daripada pengulangan · pencarian.) · Perintah ini akan bekerja pada file SQT yang diproduksi oleh greylag atau berurutan, dan · Memperbaiki beberapa masalah pemotongan di lokus yang dihasilkan oleh yang terakhir. Juga · Menghasilkan residu mengapit yang lebih baik dan menangani residu isobarik lebih banyak · Dengan benar. · `` Greylag-Validasi - Prefer-Closer-Mass`` sekarang memiliki biaya alias yang lebih baik · Penanganan. · `` Maksimum_missed_cleavage_sites`` sekarang default ke 1. · Karakter Pengembalian Carriage dalam file MS2 sekarang ditangani dengan lebih baik.

Greylag Perangkat Lunak Terkait