SMA. SMA terdiri dari koleksi kecil program yang melakukan tes berbeda untuk hubungan antara genotipe.
Unduh sekarang

SMA. Peringkat & Ringkasan

SMA. Tag

Tes asosiasi genotipe Status Penyakit Biner. Tes Genotipe. SMA. genotip

SMA. Keterangan

SMA terdiri dari kumpulan kecil dari program yang melakukan tes yang berbeda untuk hubungan antara genotipe. software SMA terdiri dari kumpulan kecil dari program yang melakukan tes yang berbeda untuk hubungan antara genotipe pada penanda tunggal dan status.Requirements penyakit biner: · Meningkatkan · GSL · SNPfileInstallation: Cara termudah untuk mengkompilasi paket ini adalah: 1. `cd' ke direktori yang berisi kode sumber paket dan jenis `./configure' untuk mengkonfigurasi paket untuk sistem anda. Jika Anda menggunakan `csh 'pada versi lama sistem V, Anda mungkin perlu mengetik` sh ./configure' sebagai gantinya untuk mencegah `csh 'agar tidak mengeksekusi` mengkonfigurasi' itu sendiri. Menjalankan `mengkonfigurasi 'perlu beberapa saat. Saat berjalan, ia mencetak beberapa pesan yang menceritakan fitur mana yang diperiksa. 2. Ketikkan `make 'untuk mengkompilasi paket. 3. Secara opsional, ketik `Make Check 'untuk menjalankan setiap tes mandiri yang menyertai paket. 4. Ketik `Make Install 'untuk menginstal program dan file dan dokumentasi data apa pun. 5. Anda dapat menghapus binari program dan mengatasi file dari direktori kode sumber dengan mengetik` membuat bersih '. Untuk juga menghapus file yang dibuat` Konfigurasikan '(sehingga Anda dapat mengkompilasi paket untuk jenis komputer yang berbeda), ketik `membuat distclean'. Ada juga target `membuat pemelihara-bersih ', tetapi itu dimaksudkan terutama untuk pengembang paket. Jika Anda menggunakannya, Anda mungkin harus mendapatkan segala macam program lain untuk file regenerasi yang datang dengan distribution.Usage: Saat ini, program hanya membaca file masukan dalam format SNPfile. Dalam format ini, protokol meta data adalah: posisi adalah std :: vector yang berisi posisi untuk setiap penanda, dalam urutan yang sama seperti kolom genotipe diperintahkan dalam matriks genotipe. fenotipe yaitu std :: vector berisi status biner penyakit (berlaku untuk yang sakit, palsu karena tidak berpenyakit) untuk setiap individu, memerintahkan dalam urutan yang sama seperti baris dalam matrix.markerNames genotipe adalah std :: vector berisi ID tali untuk setiap penanda, dalam urutan yang sama seperti kolom genotipe diperintahkan dalam matrix.This genotipe adalah protokol meta data yang sama seperti yang digunakan untuk data kasus / kontrol oleh program snp_file_convert di SNPfile package.What ini baru di Release ini: · versi ini adalah port ke SNPFile versi 2.0 Format.

SMA. Perangkat Lunak Terkait