Macs2. Peringkat & Ringkasan
- Lisensi:
- Artistic License
- Situs web penerbit:
- http://github.com/taoliu/
Macs2. Tag
Macs2. Keterangan
MacS2 adalah alat analisis berbasis model untuk data chip-seq. Dengan peningkatan teknik sekuensing, kromatin imunoprecipitasi diikuti oleh sekuensing throughput tinggi (chip-seq) semakin populer untuk mempelajari interaksi protein-DNA yang lebar genom. Untuk mengatasi kurangnya metode analisis chip-seq yang kuat, kami menyajikan algoritma baru, bernama Analisis berbasis model Chip-SEQ (Macs), untuk mengidentifikasi situs pengikat faktor transkrip. Mac menangkap pengaruh kompleksitas genom untuk mengevaluasi signifikansi daerah chip yang diperkaya, dan Mac meningkatkan resolusi spasial situs yang mengikat melalui menggabungkan informasi dari posisi dan orientasi tag sequencing. Mac dapat dengan mudah digunakan untuk data chip-seq saja, atau dengan sampel kontrol dengan peningkatan spesifisitas. Homepage produk
Macs2. Perangkat Lunak Terkait