Lingkungan Simulasi Elektrofisiologi Sel Lingkungan simulasi elektrofisiologi sel adalah lingkungan simulasi untuk elektrofisiologi.
Unduh sekarang

Lingkungan Simulasi Elektrofisiologi Sel Peringkat & Ringkasan

Lingkungan Simulasi Elektrofisiologi Sel Tag

simulasi lingkungan lingkungan simulasi. Simulasi elektrofisiologi. Elektrofisiologi.

Lingkungan Simulasi Elektrofisiologi Sel Keterangan

Lingkungan simulasi elektrofisiologi sel adalah lingkungan simulasi untuk elektrofisiologi. Lingkungan Simulasi Elektrofisiologi Sel (CESE) adalah kerangka kerja komprehensif yang dirancang khusus untuk melakukan simulasi elektrofisiologis komputasi, misalnya, simulasi aktivitas listrik miokit jantung. Lingkungan simulasi elektrofisiologi berguna untuk simulasi potensi aksi, arus ion individu, dan perubahan konsentrasi ionik .Cese adalah program lintas platform, ia berjalan pada sistem apa pun yang memiliki Java Runtime Environment (JRE) versi 1.4 atau lebih tinggi. Itu diuji pada Windows, Linux, Solaris, MacOS X, dan Pengguna Aix.Cese adalah lingkungan terintegrasi untuk melakukan simulasi komputasi menggunakan berbagai model elektrofisiologis. Pada tahap ini Cese memungkinkan penciptaan dan eksekusi model sel tunggal (mengandung keduanya Hodgkin-Huxley (HH) dan formulasi saat ini Markovia). Model aktivitas listrik miosit jantung dengan kode sumber termasuk dalam distribusi CESE. Kami berharap dapat memperpanjang jumlah model yang tersedia, dan menambahkan model neuron tertentu di masa depan. Kekuatan utama CESE dalam keseragamannya Antarmuka program tetap sama untuk berbagai jenis model. Anda dapat dengan mudah beralih di antara model dan membandingkan output simulasi. Parameter model dapat dimodifikasi, dipilih untuk output dan / atau dijepit dengan cara yang sama, standar.Cese memperpanjang makna elektrofisiologis konvensional dari "tegangan penjepit". Anda dapat menjeplikan variabel model apa pun, termasuk tegangan (potensi membran), arus ionik total atau individu, konsentrasi ionik, suhu, variabel gating, dll. Perintah penjepit dapat berupa fungsi bijaksana kompleks, diatur secara individual untuk variabel model yang menarik . Ini membuka kemungkinan tak terbatas untuk eksplorasi perilaku model yang kompleks. Sesese memberikan visualisasi data yang sederhana, tetapi efisien. Hasil simulasi dapat disajikan dalam bentuk grafik dan tabulasi. Plot dapat disesuaikan, dan wilayah yang diminati diperbesar. Meskipun CESE tidak dirancang untuk menjadi alat analisis data, Anda dapat menghasilkan hubungan tegangan saat ini (I-VS) dan menghitung parameter statistik untuk sinyal tertentu dalam program. Anda dapat mengekspor data Anda ke ASCII, File Teks Axon (ATF), dan Format NetCDF untuk melanjutkan analisis di paket favorit Anda. Pembangunan antarmuka konsistensi dan kejelasan kode dan digunakan kembali. Jika memungkinkan, Cese mengandalkan tersedia Java API (misalnya Java2D, JavaBeans, JAXP) untuk menyederhanakan pembuatan code.Model membutuhkan sejumlah fungsi rumah-menjaga untuk dikodekan ini termasuk integrator ODE, rutinitas untuk menangani parameter model, menyimpan / memulihkan model negara, visualisasi hasil simulasi, dll Cese menyediakan implementasi untuk rutinitas ini, maka, Anda dapat berkonsentrasi pada menulis kode untuk saat ini ionik beton (s), dan Cese akan menangani rest.CESE tidak mencoba untuk menciptakan rumit pemrograman kerangka kerja sendiri melainkan menggunakan inti Java API. Sebagai contoh, model komponen Java sesuai dengan spesifikasi JavaBeans. Kami menggunakan XML untuk menentukan perintah menjepit, dan Jawa serialisasi objek untuk menyimpan / mengembalikan Model parameters.What Baru di Release ini: · Rilis ini menambahkan GUI untuk mengubah jenis plot, meningkatkan kinerja, dan berisi beberapa perbaikan bug penting.

Lingkungan Simulasi Elektrofisiologi Sel Perangkat Lunak Terkait