Bioperl. ekstensi Perl untuk bioinformatika.
Unduh sekarang

Bioperl. Peringkat & Ringkasan

Bioperl. Tag

perl Ekstensi Bioperl. Perl Extensions.

Bioperl. Keterangan

Ekstensi Perl untuk bioinformatika. PROYEK BIOPERL adalah kumpulan modul Perl yang memfasilitasi pengembangan skrip Perl untuk aplikasi bioinformatika. Karena itu, tidak termasuk program yang siap digunakan dalam arti bahwa banyak paket komersial dan antarmuka berbasis web gratis (misalnya Entrez, SRS). Di sisi lain, bioperl memang memberikan modul Perl yang dapat digunakan kembali yang memfasilitasi skrip Perl untuk urutan. Manipulasi, mengakses basis data menggunakan berbagai format data dan eksekusi dan parsing hasil dari berbagai program biologi molekuler termasuk ledakan, clustalw, tcoffee, gmmer, dan hmmer. Akibatnya, bioperl memungkinkan pengembangan skrip yang dapat menganalisis sejumlah besar data urutan dengan cara yang biasanya sulit atau tidak mungkin dengan sistem berbasis web. Untuk memanfaatkan bioperl, pengguna membutuhkan pemahaman dasar tentang pemahaman tentang pemahaman Cara menggunakan Perl Referensi, Modul, Objek dan Metode. Jika konsep-konsep ini tidak terbiasa pengguna disebut salah satu dari berbagai buku pengantar atau menengah tentang perl. Kami menyukai bahasa inti Perl S. Holzmer, Coriolis Technology Press, misalnya. Tutorial ini tidak dimaksudkan untuk mengajarkan dasar-dasar Perl kepada mereka yang memiliki sedikit atau tanpa pengalaman dalam bahasa Perl. Di sisi lain, pengetahuan lanjut tentang Perl - seperti cara menulis modul Perl berorientasi objek - tidak diperlukan untuk berhasil menggunakan bioperl.bioperl adalah perangkat lunak open source yang masih dalam pengembangan aktif. Keuntungan dari perangkat lunak open source terkenal. Mereka termasuk kemampuan untuk secara bebas memeriksa dan memodifikasi kode sumber dan pembebasan dari biaya perizinan perangkat lunak. Namun, karena perangkat lunak open source biasanya dikembangkan oleh sejumlah besar programmer sukarela, kode yang dihasilkan seringkali tidak terorganisir dengan jelas dan antarmuka penggunanya tidak sama sekali distandarisasi seperti dalam produk komersial yang matang. Selain itu, dalam proyek apa pun dalam pengembangan aktif, dokumentasi mungkin tidak mengikuti perkembangan fitur baru. Akibatnya kurva belajar untuk perangkat lunak sumber open source yang dikembangkan secara aktif terkadang curam. Persyaratan: · Perl. Apa yang baru dalam rilis ini: · Ini adalah rilis inti pertama dalam seri 1,6, dan rilis stabil pertama setelah 5 tahun rilis pembangunan.

Bioperl. Perangkat Lunak Terkait